독립형 쇼핑몰은 말 그대로 쇼핑몰의 구축과 운영을 쇼핑몰 운영자가 독자적인 방식으로 진행하는 형태다.

　따라서 업체의 특성에 맞게 디자인이나 프로그램, 기능 등을 원하는 데로 제작하거나 언제든지 업체의 영업방식에 맞춰 사이트를 변경할 수 있다. 또 독자적인 도메인을 가지고 홍보와 마케팅 등을 수행하기 때문에 사이트가 발전할수록 기업과 해당 사이트의 브랜드 가치가 높아진다는 점에서 가장 바람직한 형태의 쇼핑몰 운영방식이라고 할 수 있다.

　반면 초기 ....