이용자가 방문한 웹 브라우저가 아닌 웹 브라우저가 설치한 쿠키(cookies)다. 제3자 쿠키를 통해 사용자가 방문한 다양한 웹사이트 성향이나 기기환경, 방문자 선호도 등을 파악할 수 있다. 여기서 발생한 데이터들은 주로 광고회사와 마케팅 기업의 맞춤형 광고 서비스나 통계를 분석하는 데 사용된다.

제3자 쿠키를 허용한 이용자들은 개인 맞춤형 광고에 자주 노출되는 경험을 할 수 있다. 사용자가 '프렌치토스트'를 검색하면, 얼마 지나지 않아 웹브라우저 광고에 프렌치토스트 가게, 프렌치토스트 레시피, 프렌치토스트 제품 판매 등 프렌치토스트 관련 광고를 접할 수 있다. 제3자 쿠키는 광고 사업자들과 마케팅 사업자들의 절대적인 비즈니스모델(BM)로 불린다.

하지만 제3자 쿠키 수집은 개인 맞춤형 광고의 도움을 받는 동시에, 개인정보 침해 우려도 존재한다. 웹 브라우저 방문자의 검색·물품 구입 이력·행동 패턴 등 데이터 수집 범위에 제약이 없는 데다 잦은 광고 노출로 인한 불쾌감이 발생하기 때문이다. 일부 웹 브라우저들은 당사자의 동의 없이 제3자 쿠키를 활용하는 사례도 있다.

이에 다수 브라우저들은 쿠키 차단을 지원했다. 모질라의 파이어폭스는 제3자 쿠키 차단 기능을 제공하고 있고 애플의 사파리는 기본적으로 제3자 쿠키를 차단했다. 구글은 지난 2020년 크롬에서의 제3자 쿠키를 차단하겠다고 발표했다가 최근 이를 번복했다.